手把手教你写论文：引言、方法和结论
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撰写论文是科研人员的必须工作，在已有的工作基础上，如何才能写出好的论文，将研究成果提高升华，最终登上心仪的期刊？让我们从论文最重要的几个部分入手，看看理文编辑 (Edanz Group) 资深学术总监Daniel McGowan博士的建议。
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如何写好引言 (Introduction)
“引言”必须向读者提供足够的背景信息，让他们明白你工作的来龙去脉。它不必也不应是该领域的全面文献综述—那是综述性论文的事情。相反，它应指出“现有问题”，也就是你的研究问题，从而确立该研究的根据。“引言”还应简要说明你如何着手这个问题，以及你取得的进展。换言之，“引言”应交待清楚：已有哪些相关的工作、为何需要此研究、你做了哪些工作以及你发现了什么。
在你开展研究之前，应该开展全面的文献检索；否则，就存在炒冷饭的风险。不过，在你正进行研究的几个月时间里，也有可能有类似或相关的研究发表。因此，应当随时、持续地检索文献，以确保你能立即获悉该领域的最新动态。“引言”中引用的文献应该新颖、平衡、且与你工作息息相关。也就是说，1)与你报道的工作不直接相关的不要引；2)要引用正反两方面的相关论文。除了引用你自己发表的研究以及赞同你的研究结论的其他论文外，也要引用与你的结果矛盾或持不同观点的论文；3)就某一方面的结果，只引最新论文，除非是用早前的文献来说明某种思维或方法的发展演变。只需引用最少量的背景信息，使读者能明白你研究的依据就够了。若读者想了解更多细节，他们自己会去读相关综述。所以，许多作者常常采用引用综述来缩短他们的“引言”。
在“引言”结尾可以简述一下你做了什么以及得到了什么结果，这一般是个不错的写法，但不要过于详细，否则就会变成重复“方法”和“结果”中的内容；每个部分写一两句即可。最后，任何非标准缩写、技术术语以及读者可能不熟悉的术语都要在“引言”中定义清楚。例如，一篇关于利什曼原虫的研究论文如果直到“讨论”才提及利什曼原虫是一种皮肤病（利什曼病）的致病寄生虫，将很不利于读者理解（或令读者头痛）。类似地，一篇关于蛋白Bcl - 10的研究论文也应该在“引言”中就说明这种蛋白可导致细胞凋亡和激活信号分子NF-κB，而不要留到“讨论”才讲。
上面这个的例子发表于The Journal of Clinical Investigation (doi:10.1172/JCT38289经授权转载)。作者先清楚地点出问题，接着用5段话的背景材料（此处略）来解释既有研究的结果及其意义；然后顺理成章引出本研究的根据，最后再水到渠成简介本研究的内容。本文作者不在“引言”中提及他们的研究结果，可能由于这里对本研究工作已叙述得比较详细，不过更有可能是由于JCI上的文章“引言”之后紧接着就是“结果”，而“方法”部分在“讨论”之后才出现。
核查清单
1. 用最少量的背景信息传达“现有问题”或者假说
2. 表述清楚“现有问题”或假说的背景。
3. 引用平衡的且较新的文献。
4. 明确定义技术术语和不常见的术语。
5. 最后一段简述做了哪些工作和取得了什么结果。
如何写好方法 (Methods)
“方法”(Methods)部分应包含足够的信息以供其他研究者准确重复你描述的试验；如果其中有关键信息遗漏，别人就无法完全重复你的实验条件；这会引起结果不一致，有可能造成误会，甚至还会被人指责造假。所以“方法”部分要力求全面。
“方法”部分应该使用过去时态，例如：“sections were stained with…” and “data were analyzed using…”。但是在提及图表时应使用现在时，例如：“The patients’ clinical characteristics are listed in Table 1”。 此外，当你在叙述某个事物的定义或当前对它公认的看法时也要用现在时，例如：“the cells were subjected to hypoxia, which induces HIF-1 expression…”。这句话中，虽然实验部分是用的过去时，但由于缺氧(hypoxia) 导致HIF-1是一个普遍现象而不是限定于本文的结果，因此后面半句应该用现在时。
要列出所有试剂的供应商以及设备的厂家；有的期刊还要求列出其地址，即国家、州（如为美国）和市。叙述设备、试剂盒、试剂的时候应该用常用术语来具体描述，不要只用厂商的专门术语或只写型号。比如，不要写成：“Absorbance in each well was measured at a wavelength of 492 nm using a Beckman Coulter AD 340C”，因为大多数人都对Beckman Coulter AD 340C没有任何概念；应该写成：“Absorbance in each well was measured at a wavelength of 492 nm using a multi-well plate reader (AD 340C, Beckman Coulter)”，或者“Absorbance in each well was measured at a wavelength of 492 nm using an AD 340C multi-well plate reader (Beckman Coulter Inc, Fullerton, CA, USA)”。
“方法”部分只能包括最终得出结果的实验方法。如果某个试验失败了或者没能提供你需要的结果，而且你已经决定论文中不提这些结果，那么也没有必要去谈其试验方法。用适当的子标题把各种不同目的的材料和方法分类。如果期刊设有“补充方法”（Supplementary Methods）部分，则可用这部分来详述细节，并让纸面刊出的“方法”部分保持简短。新方法应该详细叙述以便他人重复；标准和常用技术只须引用文献即可，但如果你的方法和文献有差异之处应予说明。尤其要保证所有单位都正确，实验条件（如时间、温度）都清楚。最后，如果开展了统计学分析来评价研究结果的意义，则应在“方法”的最后一段叙述你的统计学方法，包括所选择的显著性阈值。
实例
“…homogenates were spun at 10,000 × g and 4 °C for 12 min”
这句话包含了时间、温度两个重要细节。而：
“…homogenates were spun at 10,000 × g” 和更简化的 “homogenates were centrifuged”
两个句子中就遗漏这些细节。这些细节有可能对得到你的结果很重要，所以应该给出。
同理，不要只写：“Then, 10 μl of a propidium iodide solution was added to the cells”，因为这对读者毫无意义，除非他们知道该溶液的浓度。应该写成：“Propidium iodide was added to the wells to a final concentration of 0.5 μg/ml”。
下图节选自《The Journal of Clinical Investigation》所发表的一篇论文(doi:10.1172/JCI37155；经同意转载)的方法部分。它显示了“方法”部分的各种要素以及他们如何组合的。
核查清单
1. 用清楚的子标题列出用于不同目的的方法和材料。
2. 研究方法用过去时。
3. 新方法给出充足的细节以便他人重复。
4. 已有方法可用参考文献。
5. 写明厂家/供应商，必要时应提供地址。
6. 说明所采用的统计学方法。
如何写好结论 (Results)
在开始撰写“结果”之前，你应全盘考虑你的试验发现，并审视他们到底意味/提示什么。此时你应该已经完成了数据分析，并已制作了几幅图表以便简单明了地展示结果。后文将有一些图表制作和统计分析方面的注意事项，所以这里就暂不赘述。不过，一定要记得：图是“结果”的重要组成部分，所以图、表、正文之间不能有重复的叙述。简而言之，如果用图表比用文字表达得更清楚，就用图来表达，然后在正文中简单提及；如果用文字就可以简单阐明，就无需再用图来表达。
一旦确定要把哪些结果纳入正文以及这些结果的意义，你就可以把它们按一个符合逻辑的顺序组合成一个“故事”。在“引言”部分已经说明了假设或拟研究的问题；现在，在“结果”部分展示你收集的全部证据，用于支持你的假设或排除其他备择解释。用现在时态的子标题把每种不同的结果分成单独的小节。这些子标题应该与“方法”部分的子标题以及图表的标题相互对应。与“方法”部分一样，叙述“结果”时应使用过去时。你用于支持假设的证据种类越多(以及越不含混)，你的结论就越无可置疑。这里暂时不要去讨论你结果的影响或大谈其意义—那是“讨论”部分的任务。这里只用展示你的证据，然后留待读者自行去下结论。
“结果”部分经常需要比较样本和对照，或者比较某个时间点前后的结果，所以有必要了解陈述比较时一些常犯错误。其中一些也包括在“克服语言障碍”一章的注意事项中。最重要的是“同类事物间才能做比较”。例如，有这样一个句子：“Expression levels of p53 in smokers were compared with non-smokers” 就应该改成“Expression levels of p53 in smokers were compared with those in non-smokers”。这里的一个关键是“were compared” 这个短语(其他句子中也可能是 “compared with”)的位置。如果这个短语位于被比较双方 (如此例中：吸烟者的p53 levels 和 不吸烟者的p53 levels)之间，那么比较的双方都必须要有足够的信息来清楚界定到底比较的是什么。也可以把这个短语放在被比较双方之前或之后，例如：“Expression levels of p53 in smokers and non-smokers were compared”。叙述比较的另一个问题是，比较性的词语如“more”，“higher”和 “faster”等，后面需要跟一个”than”开始的从句来解释是比谁多、高或者快。比如，“transgenic mice showed higher levels of cortisol”这个句子中是比谁高就不明确，因此应该加上“than control mice”。
下图节选自《The Journal of Clinical Investigation》上一篇论文的“结果”部分(doi:10.1172/JCI37155；经同意转载)。其中显示了“结果”部分的一些要素。
核查清单
1. 你的数据如果用图表更容易表达就用图表；反之用文字。
2. 使用过去时叙述结果。
3. 同类事物才能做比较。
4. 图、表、正文内容不能重复。
5. 正文中说明统计分析结果，如P值。
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